مقالات علمی – پژوهشی:

• محمدی رئوف، مصطفی. ابوالفضل فراهانی؛ رضا شجیع؛ علی ملکی (۱۳۹۹) طراحی مدل حکمرانی ورزشی مطلوب در ایران. فصلنامه علمی-پژوهشی مدیریت ورزشی (در حال چاپ).
• فراهانی، ابوالفضل، مصطفی محمدی رئوف؛ رضا شجیع؛ علی ملکی (۱۳۹۹) شناسایی عوامل موثر بر تحقق حکمرانی مطلوب در صنعت ورزش ایران: با رهیافت داده بنیاد. مطالعات راهبردی ورزش و جوانان (در حال چاپ).
• فراهانی، ابوالفضل،  مصطفی محمدی رئوف؛ رضا شجیع؛ علی ملکی (۱۳۹۹). مطالعه تطبیقی وضعیت حکمرانی ورزشی در ایران و کشورهای منتخب. فصلنامه علمی – پژوهشی پژوهش­‌های کاربردی در مدیریت ورزشی، شماره 1 – شماره پیاپی 33، تابستان 1399، صفحه 75-96 .  شناسه دیجیتال (DOI): 10.30473/arsm.2020.7097
• ملکی, ع., یزدی, ن.ا. ۱۳۹۹. نقش ارزش ها و هنجارهای جامعه اسلامی در صورت بندی مسائل حکمرانی. فصلنامه تخصصی علوم انسانی اسلامی (صدرا). شماره ۳۴.  ۲۳۷-۲۴۲
• الله مرادی الهام، میرزامحمدی سعید، بنیادی نائینی علی، ملکی علی. عوامل موثر بر تمایل به پرداخت مصرف کنندگان برای خودروهای برقی در کشور. فصلنامه پژوهش های سیاست‌گذاری و برنامه ریزی انرژی. ۱۳۹۹; ۶ (۱) :۱۹۵-۲۲۷
• نفیسی, علیرضا, اخوان‌ علوی, سیدحسین, ملکی, علی. (139۸). شناخت و طبقه‌بندی ابعاد و نظریات تغییر در مداخلات توسعۀ اجتماع‌محور مبتنی بر ارتقای سرمایۀ اجتماعی در ایران.. مجله علمی مدیریت سرمایه اجتماعی، دوره ۷،‌ شماره۳، ۳۱۹-۳۴۳.    doi: 10.22059/jscm.2019.289140.19
• یزدی، نجم‌الدین. جاسبی، عبدالله. ملکی، علی. بنیادی نائینی، علی. مفهوم‌پردازی تطبیقی «تدارکات عمومی حامی توانمندسازی» در مقایسه با تدارکات عمومی حامی نوآوری: گامی به سوی پیاده‌سازی پیوست فناوری. فصلنامه علمی پژوهشی مدیریت نوآوری (در حال چاپ)
• کریمی، امیرعلی. ملکی، علی. (۱۳۹۸). سنجش کارایی نوآوری شرکت‌های چهار صنعت پیشرفته منتخب ایران، با استفاده از مدل جمعی تحلیل پوششی داده‌ها. فصلنامه علمی پژوهشی مدیریت نوآوری دوره ۸، شماره۲، ۷۵-۵۱
• خلیلی، سجاد. محقر، علی. اصلانی، علیرضا. ثقفی، فاطمه، ملکی، علی. ۱۳۹۷. ارائه چارچوب حکمرانی بخش بالادستی صنعت نفت، مطالعه موردی صنعت نفت ایران. فصلنامه سیاست‌گذاری عمومی. دوره ۵، شماره۲، ۲۳۶-۲۱۵
• حشمتی، عطا. ملکی، علی. ۱۳۹۷، حکمرانی مسئولانه پژوهش و نوآوری در دانشگاه‌ها، فصلنامه مطالعات اجتماعی ایران. دوره ۱۲، شماره ۲، ۲۸-۵۲
• مصلح، عرفان. ملکی، علی. ۱۳۹۷. عوامل شکست سیاست بهره‌وری انرژی در ایران. فصلنامه سیاست‌گذاری عمومی (در حال چاپ)

کتاب و فصل کتاب:

• استون،‌ دبورا. پارادوکس‌های سیاستی: هنر تصمیم‌گیری در امور سیاسی. ترجمه زهره قاسمی و علی ملکی. مشهد،‌ انتشارات پاپلی ۱۳۹۹.
• صلواتی، بهرام. ملکی، علی. ۱۳۹۷. جابجایی بین‌المللی دانشجویان و تحصیل‌کردگان (جهان و ایران)، انتشارات راه دان، تهران، ایران
• ملکی، علی. ۱۳۹۷. مدخل علم و فناوری سالنامه امنیت ملی جمهوری اسلامی ایران، انتشارات پژوهشکده مطالعات راهبردی،‌ تهران، ایران
• ملکی، علی. ۱۳۹۵. آیا اقتصادهای نفتی می‌توانند دانش‌بنیان شوند؟ (چگونه؟) در “اقتصاد دانش بنیان، بررسی نقش فناوری و نوآوری در توسعه اقتصادی”، نشر چشمه، تهران، ایران، 234-195